Non è che la salva... Semplicemente i comandi python che dai, non fanno altro che modificare un file normalissimo presente appunto al percorso
Questo file, che puoi aprire tranquillamente come file di testo, può contenere due valori: 0 o 1.
Se con un normalissimo editor di testo scrivi 1 e salvi il file, istantaneamente il led si accende.
Ovvio che se non riscrivi lo 0 e salvi nuovamente il file, il led rimane acceso.
Stesso discorso con il programma scritto con Python... Con il codice
Python non fa altro che scrivere "1" su quel file. Bisognerebbe fare in modo che al momento di premere CTRL+C, Python scriva nuovamente "0"