FreeNAS ist nur für x86 Plattformen erhältlich (ob 32 oder 64 bit ist hier egal). Der Raspberry Pi basiert jedoch auf der ARM Architektur, d.h. du wirst mit deinem Vorhaben auf jeden Fall scheitern.
dein Vorhaben ist mit sogenannten bind mounts möglich. Einfach im chroot ein Verzeichnis anlegen und den bereits bestehenden Mountpunkt der externen Platte per "mount --bind" oder permanent über die fstab dort einbinden.